Сюжет разворачивается в альтернативной вселенной. В 2003 году рабочий электростанции отключил электричество в мегаполисе и загрузил в городскую систему вирус. Чтобы избежать подобных ситуаций в будущем, власти США ввели программу CTOS (Центральная Операционная Система). К 2011 году она управляла всем Нью-Йорком, контролируя телефоны, транспорт и другие аспекты городской жизни.

Главный герой — Айден Пирс, хакер, который взломал CTOS и получил доступ к данным о жителях города и управлению городской инфраструктурой. С помощью смартфона Эйдена игрок может контролировать камеры наблюдения, светофоры, общественный транспорт, мобильные телефоны и другие системы. Например, можно заблокировать врага в скоплении машин, переключив светофоры, или остановить поезд, чтобы скрыться от полиции. 

Особенности игры:

• Открытый мир. Чикаго представлен как живой город с динамичными событиями и NPC.
• Стелс-элементы и активные перестрелки. Геймплей сочетает скрытное прохождение и боевые ситуации. 
• Влияние на сюжет. Действия игрока, связанные с взломом кодов, могут изменять ход событий.